Em meio a tudo isso, Chizuru Yukimura, uma doce menina, acaba refém do Shinsengumi, após testemunhar um terrível segredo do grupo. Numa jornada para encontrar seu pai desaparecido, Chizuru consegue a aliança do Shinsengumi e a “amizade” do vice-capitão para permanecer no quartel. Só que ela descobre que possui um bizarro segredo de família mais ligado ao Shinsengumi e às facções rebeldes do Japão do que ela poderia querer ou imaginar.